Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC1P11940 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC1P11940 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms