Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPAP09012 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNRPAP09012 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms