Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB3P05106 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB3P05106 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms