Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRNPP04156 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRNPP04156 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRNPP04156 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRNPP04156 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRNPP04156 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRNPP04156 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRNPP04156 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRNPP04156 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRNPP04156 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRNPP04156 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRNPP04156 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRNPP04156 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRNPP04156 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRNPP04156 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRNPP04156 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms