Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNCRIPO60506 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNCRIPO60506 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNCRIPO60506 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms