Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENRO43583 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DENRO43583 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DENRO43583 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DENRO43583 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DENRO43583 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DENRO43583 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DENRO43583 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DENRO43583 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DENRO43583 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DENRO43583 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DENRO43583 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DENRO43583 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DENRO43583 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DENRO43583 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DENRO43583 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DENRO43583 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DENRO43583 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DENRO43583 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2071 ms