Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN3O00409 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms