Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCCD1A6NED2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCCD1A6NED2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms