Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms