Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIAS3Q9Y6X2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIAS3Q9Y6X2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIAS3Q9Y6X2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIAS3Q9Y6X2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms