Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAPGEF2Q9Y4G8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAPGEF2Q9Y4G8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms