Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLXND1Q9Y4D7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PLXND1Q9Y4D7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms