Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF3C4Q9UKN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C4Q9UKN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms