Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX25Q9UHL0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX25Q9UHL0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX25Q9UHL0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX25Q9UHL0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX25Q9UHL0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX25Q9UHL0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms