Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00474Q9P2X8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00474Q9P2X8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms