Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PRO2289Q9P1D8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PRO2289Q9P1D8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms