Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDAP2Q9NXN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms