Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHCHD3Q9NX63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms