Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM161AQ9NX61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM161AQ9NX61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM161AQ9NX61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms