Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BSDC1Q9NW68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BSDC1Q9NW68 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BSDC1Q9NW68 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms