Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3AQ9NVI7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATAD3AQ9NVI7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATAD3AQ9NVI7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms