Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FANCIQ9NVI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCIQ9NVI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCIQ9NVI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms