Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMLHEQ9NVH6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMLHEQ9NVH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMLHEQ9NVH6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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