Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED17Q9NVC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED17Q9NVC6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms