Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC4BQ9NT99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRC4BQ9NT99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC4BQ9NT99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms