Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS4Q9NQG7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS4Q9NQG7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPS4Q9NQG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms