Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NSD3Q9BZ95 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NSD3Q9BZ95 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms