Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNG6Q9BXT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms