Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SH2D3AQ9BRG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms