Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3CQ99985 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms