Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CITED2Q99967 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms