Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY1Q96T51 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUFY1Q96T51 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUFY1Q96T51 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms