Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWNKQ96RR1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWNKQ96RR1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms