Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC2Q96PR1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC2Q96PR1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms