Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
INPP4AQ96PE3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INPP4AQ96PE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms