Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRRC1Q96M27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRC1Q96M27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms