Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00208Q96KT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00208Q96KT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms