Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16BQ96JE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC16BQ96JE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms