Protein–RNA interactions for Protein: Q96I45

TMEM141, Transmembrane protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM141Q96I45 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM141Q96I45 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM141Q96I45 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms