Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCN3Q96D15 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCN3Q96D15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms