Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP33Q8TEY7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms