Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
LRRC9Q6ZRR7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LRRC9Q6ZRR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms