Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A4Q6YBV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms