Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF19Q5T6S3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF19Q5T6S3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms