Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOHLH1Q5JUK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOHLH1Q5JUK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOHLH1Q5JUK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms