Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDK2Q58EX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDK2Q58EX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms