Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FHOD3Q2V2M9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
FHOD3Q2V2M9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
FHOD3Q2V2M9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FHOD3Q2V2M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FHOD3Q2V2M9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms