Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIF1AQ16665 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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