Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A3Q16572 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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