Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4AQ13619 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL4AQ13619 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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